“海洋的守护者，保护全球海洋资源”，一群热爱海洋的少年，他们每个人都有自己擅长的领域，组合在一起总会迸发意想不到的力量。龟博士一直致力于保护海洋资源百年，是整个护卫队导师，更是见证了多个海洋探测记录的诞生。为了深入研究并保护濒危的资源，龟博士组织了一批又一批精炼的守护者，默默地守卫着神秘而又宽广的海洋地域。地球上70%的表面被海水覆盖，深海特攻队在全球各地都配置监测系统，防止外敌入侵保护我们的海洋家园。“企图统治海洋的魔王”利末安森，率领摩多为首的黑暗军团屡次入侵海域。他们不仅要夺取海洋神秘瑰宝的晶石，还对珍贵的海洋资源加以破坏，黑暗军团已经成为海洋护卫队的第一驱逐目标。为了得到宝石，摩多挟持了海洋活化石——鹦鹉螺，利用他寻找千年晶石。小龙容带领的深海特攻队为了解救深海生灵，挽救海洋小镇，深入到黑暗领域，在新结识的各种海洋生物伙伴的帮助下，与黑暗军团展开智斗，成功破坏了利末安森的阴谋，恢复了整个海洋世界的安全。